freeeで確定申告するやり方｜準備から提出までの流れを初心者向けに解説

freeeで確定申告を行う場合、画面の質問に答えていくだけで青色申告決算書と確定申告書が自動で作成され、e-Tax（国税の電子申告システム）による送信まで一通り完結できるのが大きな特徴です。簿記の知識が少ない初心者でも、事前準備と日々の記帳の流れを押さえておけば、申告期限直前に慌てるリスクを大きく減らせます。本記事では、freeeで確定申告するやり方を「準備→記帳→書類作成→提出」の順に、初心者向けに整理して解説します。

本記事は2026年6月時点の公開情報をもとにした一般的な解説です。freeeの画面・機能は更新されることがあるため、最新の操作手順は公式ヘルプをご確認ください。税制の要件は国税庁で確認し、個別の税務判断は税理士などの専門家にご相談ください。

freeeで確定申告するメリット

freee会計の確定申告機能は、「はい・いいえ」形式の質問に答えていくと申告書類が出来上がる設計になっている点が、初心者にとって最大のメリットです。一般的な会計ソフトでは「借方・貸方」といった簿記用語と向き合う必要がありますが、freeeは「収入を登録する」「支出を登録する」といった日常の言葉に近い操作感で記帳を進められる傾向があります。

また、青色申告（事前申請をした人が複式簿記などの要件を満たすことで受けられる税制上の優遇制度）に必要な複式簿記の帳簿も、取引を登録すれば裏側で自動的に作成されます。さらに、作成した申告書をそのままe-Taxで電子送信する機能にも対応しているため、税務署に出向かずに申告を完了できる流れが整っています。

事前準備：申告前に確認しておくこと

確定申告の作業に入る前に、次の準備を済ませておくとスムーズです。

準備項目	内容	補足
開業届の提出	税務署に「個人事業の開業届出書」を提出済みか確認	未提出なら早めに提出
青色申告承認申請書	青色申告したい年の期限までに提出が必要	期限の詳細は国税庁で確認
マイナンバーカード	e-Tax送信に利用するのが一般的	読み取り用のスマホ等も準備
口座・カードの連携	事業用の銀行口座・クレジットカードをfreeeに連携	明細の自動取込が可能に
開始残高の設定	事業開始時点の口座残高などを登録	帳簿と実際の残高を一致させる

特に青色申告承認申請書は提出期限を過ぎると、その年は白色申告（事前申請が不要な代わりに優遇の少ない申告方式）になってしまいます。提出状況に不安がある場合は、税務署や国税庁のサイトで確認しておきましょう。

1年分の記帳の一般的な流れ

freeeでの記帳は、おおまかに次の流れで進みます。なお、最新の画面・手順は公式ヘルプで確認してください。

まず、連携した銀行口座やクレジットカードの明細が自動で取り込まれます。取り込まれた明細には、freeeが勘定科目（取引の内容を分類する項目。例：消耗品費、通信費）の候補を提案してくれるので、内容を確認して登録ボタンを押していくのが基本作業です。一度登録したパターンは学習される傾向があるため、続けるほど作業は速くなります。

現金払いのレシートは、スマホアプリで撮影すると日付や金額が読み取られ、取引として登録できる流れが一般的です。レシートをためこまず、週に一度など定期的に処理する習慣をつけると負担が減ります。

自宅兼事務所の家賃や電気代など、事業と私生活の両方にかかる支出は、家事按分（かじあんぶん。事業で使った割合だけを経費にする処理）の設定を行います。freeeでは按分比率を設定しておくと、決算時にまとめて反映できる仕組みが用意されています。

確定申告書類の作成：質問に答えるだけ

1年分の記帳が終わったら、freeeの確定申告メニューに進みます。一般的な流れは次のとおりです。

1. 基本情報（氏名・住所・申告の種類など）を確認する
2. 「◯◯の収入はありますか」といった質問に「はい・いいえ」で答えていく
3. 控除（税金の計算で所得から差し引ける項目）を入力する。生命保険料、ふるさと納税などの寄附金、医療費、国民年金や国民健康保険などが代表例
4. 回答内容と記帳データをもとに、青色申告決算書と確定申告書が自動で作成される

控除の入力には、保険会社から届く控除証明書や、ふるさと納税の寄附金受領証明書などの書類が必要です。秋ごろから郵送されてくるこれらの書類は、一か所にまとめて保管しておきましょう。

自分に合う会計ソフトがfreeeなのか他社なのか迷っている段階の方は、経理コンパスの無料診断でいくつかの質問に答えると、事業の状況に合った候補を整理できますので、あわせて活用してみてください。

提出方法：e-Tax送信が基本の選択肢

作成した申告書の提出方法は、主に次の3つです。

• e-Taxで電子送信する（マイナンバーカードとスマホ等を利用するのが一般的）
• 印刷して税務署に郵送する
• 印刷して税務署の窓口に持参する

青色申告特別控除の最大65万円の控除を狙う場合、e-Taxによる申告（または電子帳簿保存）が要件のひとつとされており、紙提出では控除額が下がるのが一般論です。要件の詳細は国税庁のサイトで必ず確認してください。freeeはe-Tax送信に対応する機能を提供しているため、特別な理由がなければe-Taxでの提出を前提に準備するのがおすすめです。

よくあるつまずきと対策

つまずき	起きる原因	対策
明細の重複登録	口座連携とレシート撮影で同じ支出を二重登録	登録前に同日・同額の取引がないか確認
プライベート口座の混在	事業用と私用の口座が同じ	事業専用の口座・カードを早めに分ける
申告直前の駆け込み	記帳を1年分ためこむ	月1回など定期的な記帳日を決める
控除証明書の紛失	秋に届く書類を放置	専用ファイルを作り届いたら即保管

特に多いのが、1年分の記帳を2月にまとめて行おうとして間に合わなくなるケースです。不明な取引の確認に時間がかかるため、記憶が新しいうちに処理するのが結局いちばんの時短になります。

いつから始めるべきか

理想は開業時、または年初からfreeeを使い始め、取引が発生するたびに記帳していくスタイルです。そうすれば確定申告期（例年2月16日〜3月15日ごろ）には、控除の入力と最終確認だけで済みます。

まだ何も手を付けていない場合でも、遅くとも1月には着手しましょう。口座連携の設定、開始残高の登録、1年分の明細確認には想像以上に時間がかかります。なお、口座連携で過去にさかのぼって取得できる明細の期間には限りがある場合があるため、早めに連携しておくほど安心です。

freeeには無料で試せるプランや期間が用意されているのが一般的なので、まずは実際の画面で操作感を確かめてみるのが失敗しない近道です。

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まとめ

• freeeは質問に答える形式で青色申告決算書と確定申告書を作成でき、簿記知識のハードルが低い
• 事前準備として開業届・青色申告承認申請書の提出状況、マイナンバーカード、口座連携、開始残高を確認する
• 記帳は「自動取込→勘定科目の確認・登録」が基本で、レシート撮影や家事按分の機能も活用できる
• 65万円の青色申告特別控除を狙うならe-Taxでの提出が有利という一般論があり、要件は国税庁で確認する
• 着手は早いほど楽。理想は開業時から、遅くとも1月には記帳を始め、直前の駆け込みを避ける